珍珠奶茶使用的“珍珠”，是由地瓜粉(南方说法，即淀粉)制作而成的粉圆，而粉圆在加入奶茶之前，通常还会先浸泡糖浆，确保粉圆在偏甜的奶茶中，仍可以保持甜味。奶茶的基底通常使用红茶，但也有店家提供使用绿茶的珍珠奶茶(称为珍珠绿奶或珍珠奶绿)。也有许多店家以咖啡冻、豆花、布丁、仙草、等类似口感的食物添加进奶茶里，让客人自由选择以增加口感。

至于“珍珠”，一般使用较大颗粒的粉圆，烹煮后的直径约7mm以上，否则粉圆太小，用一般口径大的茶饮吸管时容易变得“满嘴珍珠”，也不方便品尝圆润香Q的咬劲。有一阵，南台湾的泡沫红茶店将使用大颗粒粉圆的珍珠奶茶称为“波霸奶茶”，而用小颗粉圆的称为“珍珠奶茶”。但在北台湾，珍奶店通常只卖“珍珠奶茶”，都使用大颗粉圆，后来变成了全岛统一的通称和规格。

等于5个便当的热量是有点太夸张了，不过呢依各家浓度、粉圆的数量不同，热量也不同一杯。360mL珍珠奶茶约有250到300大卡的热量，相当于一碗7、8分满的白饭，因此建议适量饮用。下面是相关报导：习惯没事来杯珍珠奶茶解馋的人要注意，除了担心防腐剂外营养师指出，奶精其实热量非常高只能偶尔喝一杯，就珍珠奶茶而言，除奶精是高油脂外，珍珠粉圆本身也属于具有热量的淀粉类，“往往一杯约300mL的珍奶热量相当于一碗白饭”，而且依各家浓度、粉圆的数量不同，热量也不同，更何况很多人点饮料时，往往要点一大杯珍奶，虽满足嚼劲但也吃进更多热量。

点子：会Q的小粒方块状咖啡冻。

布丁：有以加入市售（或自制）的固体状布丁，也有些店面是以布丁粉作为调味，以奶茶常加入布丁。

仙草（广东人称作凉粉）：有些原先于冬日卖烧仙草的店家，于夏日时转型后的产物，后来被多数店家随后跟进使用。